地下城堡3的支线任务系统非常丰富，其中失子疑云是比较经典的一个。完成举手之劳后，在20年后伊瑟瑞尔的北岛雨林互动解锁任务。先去20年前的先祖之墓种下四粒种子，再到20年后摘取果实，接着去枯叶岛旅馆触发后续。记得队伍必须带上厄运之源才能在南下巨石阵触发战斗，最后回伊瑟交任务即可。这个任务流程虽然长但不复杂，关键是注意时间跨度和角色搭配。
凯拉支线任务在图十一触发，广场雕像互动后开始。先在阿克尤姆坐标(50，59)击败塔莱辛魔像，之后给凯拉面包、水果馅饼和鱼肉沙拉。空灵学院2层倒塌的塔楼获取实验笔记告知凯拉后，她会失控进入战斗。这个任务需要准备多种食物，战斗时注意凯拉有227万血量和2440伤害，建议提前强化队伍。
赛马场支线在图18，玩法比较特别。先故意输三次比赛进入骑手休息室，花费15万银币战斗获得黑马药剂。训马场马厩清完小怪后点问号找证据，回赛马场对话触发战斗。记住暗号黑马药剂，提神醒脑。白马药剂，哪里能买，去内城商店街正确回答后购买黑马药剂，最后在饲马槽使用就能赢得比赛，获得20万银币和300玉奖励。
女巫之夜幻象是较新的支线外传任务，队伍建议配满毒属性。开局辅助吼后双C吼，将虚妄之神血量压到5%以下保持战吼巨神毒效果，等不屈200层后击杀。也可以控制血量在50%-80%之间挂机普攻，待不屈0层后直接击杀。注意攻击会减少不屈层数，暴击则会增加，可以调整符文和食物来应对这个机制。
枯岩岛支线需要先在水井击败鱼人怪，获取3捆木材交给拉斐尔。船坞找伊奥要帆船手绘图，回20年前任意有北风号的地图描绘。火山岛有3波怪，建议带毒装备；密林岛4波怪难度较高，注意阵容搭配。最后在西南岛隐修院拿到罗盘完成任务。这个支线涉及多个岛屿，需要来回切换时间线，建议按步骤耐心完成。
